細胞轉錄組的時空調節(jié)對細胞內蛋白質的正常表達及細胞功能至關重要。然而，由于現有轉錄組學方法不能同時獲得時間和空間數據。美國麻省理工學院研究團隊開發(fā)了時空轉錄組測序技術，并應用于探究RNA的生成、轉運和降解速率，在亞細胞水平揭示RNA的動力學圖譜。該研究成果于近日發(fā)表在《Nature Methods》上，題為：Spatiotemporally resolved transcriptomics reveals the subcellular RNA kinetic landscape。
研究人員利用修飾堿基5-乙炔尿苷建立了一種具有單細胞分辨率且能跨時間和空間獲得RNA概況的轉錄組測序技術（TEMPOmap）。利用該技術，研究人員在亞細胞水平構建了多種人類細胞RNA從轉錄、轉運到降解的動力學圖譜。對單個細胞的RNA動力學參數進行聚類分析，他們提出了“動力學基因簇”。這些基因簇有不同的時間表達特征和亞細胞分布，在功能上也相互獨立，表明不同功能RNA在細胞周期內被動態(tài)調控。
綜上，研究人員建立的時空轉錄組測序技術可為精準研究RNA時空調控和發(fā)現新的基因表達調控機制提供工具。
注：此研究成果摘自《Nature Methods》期刊原文章，文章內容不代表本網站觀點和立場，僅供參考。
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