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人類微生物組計劃第二階段取得新進展

    近日,美國哈佛大學和博德研究所的科研人員在Nature上發(fā)表了題為“Multi-omics of the gut microbial ecosystem in inflammatory bowel diseases”的文章,研究人員利用多組學技術,針對在炎癥性腸?。↖nflammatory Bowel Diseases,IBD)期間微生物組的變化以及引發(fā)炎癥反應的機制開展研究,為IBD的治療提供具有潛力的技術手段。

    IBD包括克羅恩病和潰瘍性結腸炎,在全世界數百萬人中普遍存在。克羅恩病和潰瘍性結腸炎是一種復雜疾病,在臨床、免疫學、分子、遺傳和微生物水平上均具有異質性。作為整合人類微生物組項目(HMP2或iHMP)的一部分,研究人員對132名受試者進行了為期一年的研究,以生成疾病期間宿主和微生物活動的綜合縱向分子譜(每人最多24個時間點;總共2,965個糞便、活檢和血液樣本)。研究人員總結出炎癥性腸病活動期間腸道微生物組功能性失調的綜合視圖,并發(fā)現兼性厭氧菌的特征性增加同時伴有專性厭氧菌的減少,微生物轉錄(例如梭菌屬)過程和代謝物庫(?;鈮A,膽汁酸和短鏈脂肪酸)的分子破壞,以及宿主血清中的抗體水平變化。疾病活動時期也以時間變異性的增加為特征,具有特征性的分類學、功能和生化等方面的變化。

    該研究的結果和數據,通過炎癥性腸病多組學數據庫(http://ibdmdb.org)開放,這是迄今為止對炎癥性腸病宿主和微生物活動描述最全面的數據庫,將為IBD的預后提供新型的生物標志物,用于改善該疾病的治療。(摘譯自Nature, Published: 29 May 2019)

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